Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHV3-33P01772 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHV3-33P01772 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms