Protein–RNA interactions for Protein: P01584

IL1B, Interleukin-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1BP01584 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1BP01584 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL1BP01584 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL1BP01584 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL1BP01584 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IL1BP01584 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL1BP01584 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL1BP01584 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL1BP01584 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL1BP01584 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IL1BP01584 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IL1BP01584 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL1BP01584 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1BP01584 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1BP01584 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1BP01584 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1BP01584 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL1BP01584 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms