Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
F9P00740 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
F9P00740 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
F9P00740 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F9P00740 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F9P00740 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F9P00740 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
F9P00740 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
F9P00740 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
F9P00740 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
F9P00740 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
F9P00740 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
F9P00740 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
F9P00740 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
F9P00740 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms