Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3BO95985 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3BO95985 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms