Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACSL3O95573 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACSL3O95573 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACSL3O95573 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms