Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SYNGR4O95473 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYNGR4O95473 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms