Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RAPGEF3O95398 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
RAPGEF3O95398 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RAPGEF3O95398 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms