Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SNAPINO95295 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNAPINO95295 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNAPINO95295 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms