Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCNDBP1O95273 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNDBP1O95273 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms