Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIF4AO95239 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIF4AO95239 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIF4AO95239 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms