Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ECM2O94769 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ECM2O94769 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ECM2O94769 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ECM2O94769 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ECM2O94769 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ECM2O94769 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ECM2O94769 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ECM2O94769 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms