Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEBLO76041 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEBLO76041 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEBLO76041 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEBLO76041 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEBLO76041 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NEBLO76041 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEBLO76041 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEBLO76041 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEBLO76041 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEBLO76041 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEBLO76041 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEBLO76041 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEBLO76041 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms