Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIOO75962 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIOO75962 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOO75962 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOO75962 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOO75962 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOO75962 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIOO75962 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIOO75962 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIOO75962 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOO75962 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOO75962 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOO75962 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIOO75962 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOO75962 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOO75962 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOO75962 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOO75962 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIOO75962 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOO75962 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOO75962 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOO75962 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOO75962 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms