Protein–RNA interactions for Protein: O75610

LEFTY1, Left-right determination factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEFTY1O75610 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LEFTY1O75610 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LEFTY1O75610 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms