Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LGR5O75473 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LGR5O75473 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LGR5O75473 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LGR5O75473 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LGR5O75473 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LGR5O75473 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LGR5O75473 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGR5O75473 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms