Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP9AO75110 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP9AO75110 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP9AO75110 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms