Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCN2BO60939 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms