Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXD2O60548 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD2O60548 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms