Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEP104O60308 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CEP104O60308 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CEP104O60308 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CEP104O60308 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CEP104O60308 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CEP104O60308 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CEP104O60308 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP104O60308 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms