Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP9BO43861 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP9BO43861 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms