Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDIL3O43854 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDIL3O43854 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms