Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTAO43765 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTAO43765 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTAO43765 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTAO43765 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGTAO43765 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTAO43765 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTAO43765 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms