Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYNGR2O43760 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms