Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BUD23O43709 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BUD23O43709 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BUD23O43709 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BUD23O43709 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BUD23O43709 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BUD23O43709 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BUD23O43709 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BUD23O43709 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms