Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN6O43657 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN6O43657 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN6O43657 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms