Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAD51CO43502 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAD51CO43502 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms