Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRPF3O43395 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PRPF3O43395 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms