Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTIFO43310 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTIFO43310 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTIFO43310 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTIFO43310 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTIFO43310 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTIFO43310 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTIFO43310 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTIFO43310 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTIFO43310 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
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