Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SRGAP3O43295 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP3O43295 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP3O43295 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SRGAP3O43295 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP3O43295 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP3O43295 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SRGAP3O43295 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SRGAP3O43295 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SRGAP3O43295 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SRGAP3O43295 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SRGAP3O43295 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SRGAP3O43295 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms