Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TM7SF2-211ENST00000528026 582 ntTSL 318.45■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-205ENST00000525385 1014 ntTSL 518.45■□□□□ 0.541e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-204ENST00000524986 729 ntTSL 318.16■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-208ENST00000526809 829 ntTSL 518.12■□□□□ 0.491e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-225ENST00000534371 913 ntTSL 517.94■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 25
PRPF4O43172 TM7SF2-207ENST00000526085 570 ntTSL 514.81□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 25
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PRPF4O43172 ASPHD1-202ENST00000414952 1451 ntTSL 222.8■■□□□ 1.242e-7■■■■□ 24.9
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PRPF4O43172 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.518e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.478e-8■■■■□ 24.8
PRPF4O43172 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.438e-8■■■■□ 24.8
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PRPF4O43172 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 24.8
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