Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLOCKO15516 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CLOCKO15516 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms