Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RIMBP2O15034 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RIMBP2O15034 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RIMBP2O15034 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms