Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 YIPF1-206ENST00000472983 792 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.179e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-206ENST00000526920 1151 ntTSL 313.69□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.29□□□□□ -0.282e-11■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-217ENST00000575447 559 ntTSL 213.23□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-202ENST00000303665 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 YIPF1-202ENST00000371399 1503 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZNF473-208ENST00000599155 558 ntTSL 412.27□□□□□ -0.459e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ETHE1-202ENST00000594342 702 ntTSL 211.83□□□□□ -0.529e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 KDSR-203ENST00000585456 476 ntTSL 311.83□□□□□ -0.521e-10■■■■■ 42
DDX3XO00571 PLEKHA8-206ENST00000483799 563 ntTSL 510.86□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 NMT2-201ENST00000378150 2457 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 410.38□□□□□ -0.759e-18■■■■■ 42
DDX3XO00571 MAPT-AS1-204ENST00000634876 3602 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 TMEM107-209ENST00000533070 726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-212ENST00000573625 602 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 ARHGAP17-203ENST00000455311 810 ntTSL 58.38□□□□□ -1.072e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 YIPF1-203ENST00000464950 1602 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.522e-9■■■■■ 42
DDX3XO00571 SRD5A3-202ENST00000505210 768 ntTSL 35.4□□□□□ -1.541e-12■■■■■ 42
DDX3XO00571 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.17e-27■■■■■ 42
DDX3XO00571 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.387e-27■■■■■ 42
DDX3XO00571 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.267e-27■■■■■ 42
DDX3XO00571 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-27■■■■■ 42
DDX3XO00571 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.187e-27■■■■■ 42
DDX3XO00571 ALDOA-205ENST00000562168 666 ntTSL 311.35□□□□□ -0.597e-27■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.42e-8■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZNF395-207ENST00000521185 584 ntTSL 418.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZNF395-205ENST00000520290 703 ntTSL 517.62■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 42
DDX3XO00571 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 214.49□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 42
DDX3XO00571 ZNF395-209ENST00000522795 501 ntTSL 313.73□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 42
DDX3XO00571 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.077e-10■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.549e-8■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.348e-12■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 MRPS2-207ENST00000485333 881 ntTSL 220.38■□□□□ 0.858e-12■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.838e-12■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 MRPS2-204ENST00000462948 551 ntTSL 218.02■□□□□ 0.488e-12■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 MRPS2-205ENST00000472852 854 ntTSL 318.02■□□□□ 0.488e-12■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 MRPS2-208ENST00000488610 928 ntTSL 317.39■□□□□ 0.378e-12■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 NF2-211ENST00000432151 1000 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 NF2-206ENST00000361676 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 41.9
DDX3XO00571 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.863e-8■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TXNL4A-204ENST00000585769 988 ntTSL 222.6■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)19.88■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TMED3-204ENST00000543455 1483 ntTSL 219.01■□□□□ 0.638e-10■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.638e-10■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.518e-10■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.348e-10■■■■■ 41.8
DDX3XO00571 STIM1-204ENST00000525403 625 ntTSL 47.91□□□□□ -1.145e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.757e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-204ENST00000529460 457 ntTSL 311.65□□□□□ -0.547e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-207ENST00000533172 336 ntTSL 210.01□□□□□ -0.817e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-202ENST00000524422 720 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.97e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-208ENST00000534385 623 ntTSL 28.41□□□□□ -1.067e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-205ENST00000529770 575 ntTSL 27.85□□□□□ -1.157e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ATP5L-206ENST00000529790 900 ntTSL 26.11□□□□□ -1.437e-47■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ARHGEF39-206ENST00000490970 1270 ntTSL 516.34■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ARHGEF39-205ENST00000490638 4498 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ARHGEF39-203ENST00000475323 2862 ntTSL 214.75□□□□□ -0.057e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 ARHGEF39-201ENST00000378387 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.617e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 RNF41-206ENST00000549038 890 ntTSL 311.17□□□□□ -0.627e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 RNF41-207ENST00000549119 796 ntTSL 59.88□□□□□ -0.837e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.087e-8■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 TSEN54-205ENST00000578415 994 ntTSL 320.82■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.061e-16■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-16■■■■■ 41.7
DDX3XO00571 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.613e-14■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.614e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.493e-14■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.164e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.234e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.234e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-207ENST00000440082 1012 ntTSL 211.65□□□□□ -0.544e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-208ENST00000447901 784 ntTSL 211.65□□□□□ -0.544e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 GGCT-204ENST00000409390 767 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.84e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.214e-34■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-213ENST00000447825 896 ntTSL 324.26■■□□□ 1.475e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-207ENST00000406771 652 ntTSL 516.96■□□□□ 0.315e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-209ENST00000430276 896 ntTSL 515.45■□□□□ 0.065e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-215ENST00000452261 769 ntTSL 512.94□□□□□ -0.345e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.365e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-210ENST00000432589 210 ntTSL 312.48□□□□□ -0.415e-13■■■■■ 41.6
DDX3XO00571 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.55e-13■■■■■ 41.6
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