Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10AO00220 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFRSF10AO00220 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms