Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC01387J3KSC0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01387J3KSC0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms