Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRN3E7EW58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRN3E7EW58 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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