Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP99D6REC4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFAP99D6REC4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms