Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRDCB7Z8K6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms