Protein–RNA interactions for Protein: B4DLN1

cDNA FLJ60124, highly similar to Mitochondrial dicarboxylate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DLN1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
B4DLN1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
B4DLN1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
B4DLN1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4DLN1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4DLN1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
B4DLN1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4DLN1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4DLN1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4DLN1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4DLN1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms