Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
B4DEV8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
B4DEV8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
B4DEV8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
B4DEV8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DEV8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DEV8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DEV8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DEV8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
B4DEV8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
B4DEV8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
B4DEV8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
B4DEV8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
B4DEV8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms