Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B2RBV5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B2RBV5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
B2RBV5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
B2RBV5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
B2RBV5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B2RBV5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B2RBV5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
B2RBV5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms