Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BECN2A8MW95 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BECN2A8MW95 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms