Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIGD1CA8MV81 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIGD1CA8MV81 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms