Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEURL1BA8MQ27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms