Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KNCNA6PVL3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KNCNA6PVL3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms