Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC169A6NNP5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC169A6NNP5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms