Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC69A6NI79 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC69A6NI79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC69A6NI79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms