Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC160A6NGH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC160A6NGH7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms