Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC182A6NF36 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC182A6NF36 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms