Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00862A6NCI5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00862A6NCI5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms